Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc183A2AJB1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc183A2AJB1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc183A2AJB1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc183A2AJB1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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