Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Kiaa1109A2AAE1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms