Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms