Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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