Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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