Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek4Q9Z1J2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms