Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms