Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vav3Q9R0C8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Vav3Q9R0C8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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