Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gpc1Q9QZF2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms