Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sall2Q9QX96 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sall2Q9QX96 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms