Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgm1Q9JLF6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgm1Q9JLF6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgm1Q9JLF6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgm1Q9JLF6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tgm1Q9JLF6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tgm1Q9JLF6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tgm1Q9JLF6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tgm1Q9JLF6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tgm1Q9JLF6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tgm1Q9JLF6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgm1Q9JLF6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms