Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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SacsQ9JLC8 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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