Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nectin3Q9JLB9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms