Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms