Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tlr1Q9EPQ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tlr1Q9EPQ1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tlr1Q9EPQ1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tlr1Q9EPQ1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms