Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms