Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr38-201ENSMUST00000074499 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms