Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms