Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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