Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms