Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms