Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sdr42e1Q9D665 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms