Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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