Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iqcf3Q9D498 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms