Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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