Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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Ube2cQ9D1C1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2cQ9D1C1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Ube2cQ9D1C1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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