Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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