Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms