Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms