Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms