Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhobtb3Q9CTN4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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