Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms