Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Higd2aQ9CQJ1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms