Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms