Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krt88Q9CPR6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms