Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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