Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufsp2Q99K23 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms