Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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