Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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