Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc8b1Q925Q3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc8b1Q925Q3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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