Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Xrcc4Q924T3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc4Q924T3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms