Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Paip1Q8VE62 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Paip1Q8VE62 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms