Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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