Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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