Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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