Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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