Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms