Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cchcr1Q8K2I2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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