Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms