Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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